伊通自然资源丰富。森林覆盖率达26.4%。有中型水库4座、小型水库29座及众多塘坝。已探明的矿产和非矿产资源有33种，矿产地200余处。境内的伊舒盆地石油总储量5.3亿吨，天然气储量超过千亿方。已探明在伊通境内可供开采原油9470万吨；地热储量巨大，已进入探索利用阶段，力争将我县打造为“火山温泉之乡”；风能资源丰富，发展前景广阔；伊通河起源于伊通河源镇青顶山，为县内最大河流，境内全长80.4公里，穿城而过后进入长春市郊区，向北流入新立城水库，是长春市的母亲河。特有的火山地质形成了宝贵的矿泉水资源，富含锌、锶、偏硅酸、铜、镍、铬等多种对人体有益元素，储量在100亿立方以上。