伊通境内金属、非金属矿藏均有储藏。已发现的有金、银、铜、铁、铅、锌、硫铁、硅石、萤石、石灰石、麦饭石、硅灰石、玄武岩、膨润土、高岭土、粘土、煤、石油、天然气、矿泉水等30余种，矿产地200余处。

　　石油天然气：伊通盆地莫里青断陷面积540平方公里。据最新一轮地质研究和部署揭示，伊通盆地勘探潜力为石油5.3亿吨、天然气1000亿方以上。目前该区域由吉林油田公司和美国MI能源公司共同开发。截止2010年底，莫里青油田开发项目累计投资44.5亿元，油井总数达到348口，年产能达到50万吨，相继建成两座原油处理联合站，年处理原油能力达到80万吨；

　　金：主要分布在伊通镇、营城子镇、莫里乡等3个乡镇，资源总量约为7吨，平均品位是1.0—2.0克/吨，属贫矿床，但矿石氧化较好，适合露天开采，堆浸喷淋工艺；

　　锌：主要分布在景台镇和莫里乡交界处的放牛沟、老虎沟一带，锌金属资源储量达到139万吨，属中型矿床，平均品位9%，是吉林省有色金属的重要接续基地；

　　铁：主要分布在景台镇、莫里乡、黄岭子镇、营城子镇等乡镇，保有资源储量矿石量451万吨；

　　铜：主要位于景台镇永久村，保有资源储量315万吨，有五个矿体；

　　硅石：主要分布在景台、莫里、马鞍、营城子、伊通镇等乡镇，远景资源总量超过100万吨，多数硅石矿可露天开采，交通较为便利；

　　萤石：主要分布在营城子镇、莫里乡、伊通镇，资源总量约为20万吨；

　　硫铁矿：主要分布在景台镇放牛沟、莫里乡老虎沟一带，保有资源储量176万吨；

　　硅灰石：主要分布在二道镇、营城子镇、河源镇，储量37万吨，现已开发并出口创汇；

　　水泥用大理岩：分布较广，预测资源总量1.8亿吨以上，均适合露天开采；

　　麦饭石：1987年通过省级鉴定，定名为“吉林麦饭石”，产于大孤山镇石匠背山，矿石保有资源储量160万吨，适宜露天开采；

　　脱硫黄土：又称氧化铁粉，广泛用于煤气、化工、电子等行业，产于放牛沟的脱硫黄土，脱硫效果极佳，最高可达99.2%；

　　膨润土：主要分布在马鞍镇和莫里乡，又名斑脱岩，具有强烈的吸水性，主要用于钢铁、石油、纺织、化工等行业，工业储量为143.4万吨；

　　高岭土：主要分布在景台镇，储量100万吨，预测远景储量约200万吨以上，矿石呈灰白色、浅粉色，土状结构，含二氧化硅43.18%，二氧化铝30.14%；

　　煤炭：主要分布在大孤山镇，属褐煤，分布面积近10平方公里，目前年开采能力6.6万吨，煤层厚度20余米，埋深2100米，目前开采难度较大。2008年，省地矿局煤炭勘探队在大孤山镇杨树村、柴永村勘探，以探明储量1.5亿吨；；

　　矿泉水：全县已勘查评价三处优质矿泉水，分布在河源镇、景台镇、大孤山镇三个乡镇。特别是河源镇石头泉眼屯莲花泉，偏硅酸含量为38.75毫克/升，平均流量为149.25立方米/日，开采条件极为便利。